粘液を英語でmucus（ミューカス）といい、これを溶かすことをmucolysis といいます。この粘液溶解を意味してムコフィリンとしました。

（参考）

・ムコフィリン吸入液 20% インタビューフォーム 2011年4月改訂（改訂第4版）Ⅱ. 名称に関する項目 1.販売名 (3)名称の由来